Universitas Madani Indonesia mempunyai bendera terdiri dari bendera universitas dan bendera fakultas-fakultas.
1. Bentuk Bendera
Bendera Universitas dan fakultas-fakultas berbentuk persegi panjang dengan perbadingan panjang:lebar adalah 3:2
2. Isi Bendera
a. Di tengah-tengah bendera universitas terdapat lambang UMINA
b. Di tengah-tengah bendera Fakultas, terdapat lambang UMINA dan nama fakultas yang bersangkutan yang di tulis di bawah lambang UMINA
3. Warna dasar bendera
a. Warna dasar bendera Universitas : Hijau Muda
b. Warna dasar bendera Fak. Saintek : Biru Tua
c. Warna dasar bendera Fak. Ilmu Pendidikan dan Ekonomi : Biru Muda
d. Warna dasar bendera Fak.Vokasi : Orange
